MGPS & l'INRA
The microbiota in human health
and well being.

Métagénomique Quantitative

Le microbiote intestinal constitue un écosystème doté d’un intérêt majeur pour le domaine biomédical. La métagénomique quantitative étudie le génome des espèces composant cet écosystème spécifique. En utilisant cette méthode, nous pouvons analyser la diversité de l’ADN bactérien et établir l’abondance relative de ses composants. Cette approche a été massivement utilisée ces 5 dernières années notamment dans le cadre des projets MetaHIT et Micro-Obes coordonnés par l’INRA, respectivement par S.Dusko Ehrlich et Joël Doré, tous deux principaux investigateurs dans Metagenopolis. 

 

Ces projets ont conduit à d’importantes découvertes et ont démontré le leadership d’MGP dans ce domaine de recherche.

2010 - Création du catalogue de gènes microbiens intestinaux, 3,3M de gènes  (Qin et al., Nature 2010)

2011 - Découverte des enterotypes  (Arumugam et al., Nature 2011)

2012 - Caractérisation du microbiote intestinal des patients atteint de diabète de type 2  (Junjie et al.,  Nature 2012)

2013 - Mise en évidence d’une corrélation entre une faible richesse bactérienne du microbiote intestinal et un risque accru de développer des maladies liées à l’obésité  Lechatelier et al., Nature 2013

Mise en évidence de l’impact d’une intervention nutritionnelle sur la richesse bactérienne du microbiote intestinal  (Cotillard et al., Nature 2013)

2014 - Découverte d’une méthode basée sur l’analyse du microbiote intestinal permettant de diagnostiquer les personnes attente de cirrhose du foie  (Nan Qin et al., Nature 2014)

2014 - Extension du catalogue de gènes microbiens intestinaux à 9.8M de gènes (Junhua Li et al. Nature Biotechnology 2014)

2014 - Découverte d’une approche révolutionnaire pour étudier le microbiote intestinal (Nielsen et al. Nature Biotechnology 2014)

 

The discoveries described in these publication are based on our capacity to detect the presence and calculate the abundance of each gene from the catalogue, as well as the variants of the strains and genes in each individual.

Les découvertes décrites dans ces publications sont basées sur notre capacité à détecter l’existence et à calculer l’abondance de gènes issus du catalogue, ainsi que les différentes souches présentes dans chaque individu. Toutes ces technologies préparent la voie pour une exploration du microbiote intestinal dans de multiples pathologies ainsi que le développement d’applications d’intérêt pour les communautés académiques, médicales et les industrielles :

 

Médecine :

Met en pratique de nouveaux biomarqueurs de la maladie

Module le microbiome des patients

Rationalise des stratégies d’intervention afin de moduler le microbio

Nutrition

Met en évidence les effets bénéfiques de certains aliments sur la santé

Caractérise de manière exhaustive les levains naturels/traditionnels (en collaboration avec l’unité de recherche MICALIS à l’INRA)

Anticipe l’impact de procédés de fabrication sur le microbiote de produits fermentés (en collaboration avec l’unité de recherche MICALIS à l’INRA)

Médecine personnalisée et soins

Développe des traitements personnalisés basés sur la stratification des bons et mauvais répondants

Identifie des biomarqueurs liés au régime nutritionnel

Etablit des recommandations nutritionnelles fondées sur le statut du microbiote

Les projets de métagénomique quantitative font appel à l’expertise des plateformes SAMBO, METAQUANT et IBS

 

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