Le microbiome intestinal abrite une grande diversité de déterminants de la résistance aux antibiotiques (ARD). Au MetaGenoPolis, les scientifiques ont développé une nouvelle méthode innovante basée sur la 3D afin de prédire et d’étudier la diversité des gènes AR intestinaux dans le microbiome de l’intestin. En effet, ils ont développé et validé une méthode d’annotation sur la base d’une structure tridimensionnelle (PCM), permettant de prédire 6 095 ARD à partir du microbiome intestinal humain. Les scientifiques ont trouvé peu de preuves de leur transfert entre espèces : Les ARD ont pour la plupart peu de chances d’être transférés à des bactéries pathogènes. Enfin, en fonction de la composition de leur résistome, les auteurs ont pu regrouper les sujets de la cohorte MetaHIT en six résistotypes.
https://www.nature.com/articles/s41564-018-0292-6
https://www.pasteur.fr/fr/espace-presse/documents-presse/plus-6000-genes-resistance-aux-antibiotiques-decouverts-microbiote-intestinal