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Métagénomique quantitative

Séquençage du Génome Entier

Analyser et modéliser la diversité et la composition des microbiomes complexes

Notre équipe assure une qualité optimale de données. Une expertise en bioinformatique et en statistiques avec une exploitation de données multivariées et hétérogènes.

Nous pouvons générer des données grâce à notre plateforme de séquençage haut débit ISO9001 ou vous pouvez fournir vos propres données!

Le séquençage à haut débit de l'ADN des bactéries vivant dans le tube digestif permet la stratification des individus et la caractérisation de leur microbiome.

Dusko Ehrlich - Directeur scientifique de Metaquant

Une grande capacité de traitement en constante évolution

  • 10 000

    échantillons séquencés et analysés par an

  • 3 000 000

    GO de stockage des données

  • 1 000 coeurs

    Installation de calcul à haute performance

Séquençage entier du métagénome

Analyse du microbiome à haute résolution avec des pan-génomes d'espèces métagénomiques (MSPs)

Pipeline intégré de séquençage à haut débit et de profils métagénomiques à haute résolution d'échantillons intestinaux

Capture des gènes de base et des gènes accessoires des espèces microbiennes, méthode publiée dans Bioinformatique (2019)

Caractérisation de la communauté microbienne au niveau de la souche, variabilité inter-individuelle et annotation fonctionnelle du microbiome

Shotgun et shallow métagénomiques réalisées par nos performantes équipes de séquençage, bio-informatique et de scientifiques

Découvrir la diversité des microbiomes

Catalogues de gènes et d'espèces pour divers microbiomes

Construction de catalogue de gènes de-novo

Identification, annotation et profilage des pan-génomes d'espèces métagénomiques

Cartographie du microbiome humain ou animal qui n'a pas encore été exploré

Applications concrètes pour la santé humaine dans les domaines médical et nutritionnel

Identifier les biomarqueurs associés à la dysbiose : signatures microbiennes utilisées comme outils de diagnostic ou de pronostic

Étudier l'impact des prébiotiques, probiotiques, médicaments, aliments fonctionnels sur le microbiome intestinal : modulation de la composition taxonomique et fonctionnelle

Stratification des individus pour la médecine personnalisée : individus répondeurs et non-répondeurs (composition du microbiome basal)

Notre offre

Services

Cartographie des espèces à partir d'un microbiome déjà caractérisé (1)

Cartographie fonctionnelle d'un microbiome déjà caractérisé (2)

Cartographie d'un microbiome inexploré

Étudier l'impact d'un ingrédient/molécule sur un microbiome déjà caractérisé (2)

Dépistage des signatures basées sur les microbes à des fins de diagnostic, de pronostic ou de prévision (2)

Concevoir des modèles prédictifs (2)

SANS SÉQUENÇAGE

(Données clients)

De

40€ / unité

De

100€ / unité

De

200€ / unité

Services

Cartographie des espèces à partir d'un microbiome déjà caractérisé (1)

Cartographie fonctionnelle d'un microbiome déjà caractérisé (2)

Cartographie d'un microbiome inexploré

Étudier l'impact d'un ingrédient/molécule sur un microbiome déjà caractérisé (2)

Dépistage des signatures basées sur les microbes à des fins de diagnostic, de pronostic ou de prévision (2)

Concevoir des modèles prédictifs (2)

AVEC SÉQUENÇAGE

(génération de données ISO9001)

De

180€ / unité

De

410€ / unité

De

490€ / unité

(1) Estimation du prix pour une étude de 200 échantillons, 1Mreads, avec propriété industrielle partagée
(2) Estimation du prix pour une étude de 200 échantillons, 20Mreads, avec propriété industrielle partagée

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