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Métagénomique fonctionnelle

Criblage à haut débit

Recherche de bactéries inconnues pour la découverte de nouveaux composés bioactifs

Cette approche innovante est basée sur un ensemble de technologies de criblage à haut débit permettant l'analyse de l'ensemble du génome de tous les micro-organismes appartenant à une niche écologique, y compris ceux qui ne sont pas cultivables.

Hervé Blottière - Directeur scientifique de Metafun

Un processus automatisé assurant un criblage à haut débit

  • 575 000

    clones fabriqués

  • 23 MILLIONS

    de gènes inconnus clonés

  • 400 000

    gènes testés / semaine

  • Une méthode certifiée pour la production de librairies

    Construction de large insert génomique et de librairies métagénomiques

    Criblage fonctionnel de grandes bibliothèques de clones avec des milliers de fragments d’ADN génomiques ou métagénomiques >> Identification des échanges bactéries – cellules

    Implémentation d’essais biologiques sur cellules à l’aide d’une stratégie à haut débit >> Identification des gènes bactériens fonctionnels et des voies métaboliques impliqués dans le dialogue avec l’hôte

    En savoir plus

    -

  • Voies de signalisation criblées

    Construction de librairies métagénomiques

    Réplication de librairies

    Culture automatisée de clones bactériens, suivie d’une lyse et d’une filtration

    Développement de nouveaux outils de criblage (test cellulaire utilisant la technologie du gène rapporteur)

    Criblage à haut débit sur des cellules épithéliales humaines, y compris la mesure des activités des gènes rapporteurs (luminescence (HTS), fluorescence (HCS), absorbance)

    Analyse par cytométrie de flux et tri des cellules

    En savoir plus

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  • Partenariats

    Notre équipe est prête à collaborer avec les communautés scientifiques et industrielles, en mettant en œuvre ses compétences et son savoir-faire pour:

    La conception de projets de métagénomique fonctionnelle:
    – Conseils d’experts pour la conception de l’étude
    – Construction de large insert génomique et de librairies métagénomiques
    – Criblage fonctionnel et analyse

    Le criblage à haut débit des bibliothèques existantes: de la construction du projet à l’analyse des résultats

     Principaux domaines de recherche avec nos partenaires industriels:
    – Criblage des espèces/souches microbiennes susceptibles d’interagir avec l’hôte
    – Identification de la fonction d’une espèce/souche sur une voie métabolique spécifique : immunité, barrière intestinale, inflammation, récepteur du goût, stress oxydatif.
    – Impact d’une molécule ou d’un nutriment sur le métabolisme microbien (synthèse ou catabolisme: métabolites bactériens)

     

    En savoir plus

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Applications concrètes

Explorer les mécanismes/interactions entre les bactéries intestinales et les cellules humaines et découvrir de nouveaux médicaments

575 000 clones prêts à être testés (avec des gènes bactériens inconnus). 18 bibliothèques de sujets sains, obèses, atteints de la maladie de Crohn, du CRC, de l'iléon/des muqueuses

Identification des gènes d'intérêt pour votre produit (probiotiques, bactéries commensales...) sur des fonctions intestinales ciblées (endocriniennes, métabolisme, barrière intestinale, immunité)

Identification de molécules (métabolites, protéines...) d'intérêt pour la découverte de médicaments ou l'optimisation de la nutrition

Notre offre

Services

Test de nos clones

Identification de gènes d'intérêt

Identification de molécules

PRIX

1.80 € HT / point

sur demande

sur demande

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