Cette série de SOPs de MGP est la continuation des développements de standards effectués dans le cadre du projet original des Standards Internationaux du Microbiome Humain (IHMS). Ce SOP est une mise à jour de la version IHMS_SOP 006. Si vous souhaitez consulter les SOPs originaux de l’IHMS, veuillez consulter le site http://www.microbiome-standards.org/.
Ce SOP est recommandé en remplacement du SOP IHMS_SOP 006 V2 car QIAGEN ne commercialise plus le kit QIAamp DNA stool. Elle nécessite le QIASymphony DSP Virus/Pathogen Midi Kit et l’instrument QIASymphony SP du même fournisseur.
Ce SOP est de premier intérêt pour l’extraction automatisée, rapide et fiable de l’ADN d’échantillons fécaux à forte teneur en biomasse, afin de caractériser le microbiote fécal par profilage métagénomique. Pour les échantillons à faible teneur en biomasse, ou si l’automatisation n’est pas souhaitée, veuillez consulter le MGP_SOP 002 V1 à la place.