MGPS & l'INRA
The microbiota in human health
and well being.

MetaQuant

MetaQuant est la plateforme de MetaGenoPolis en charge du séquençage métagénomique, qui vise à être la plus performante en termes de qualité, rapidité de production, robustesse, avec une capacité permettant d’attendre nos objectifs. 

 

En 8 ans, la contribution de la plateforme a été reconnue au travers de publications dans des journaux du groupe Nature et autres publications internationales de haut niveau. MetaQuant poursuit son objectif d'augmentation de sa qualité et capacité, par l'automatisation de ses ateliers, et en menant une veille constante des avancées technologiques pertinentes pour le domaine, de façon à atteindre nos objectifs d'une production de niveau industriel. 

 

Le niveau actuel de performance de MetaQuant a été rendu possible par l'acquisition de l'équipement le plus adapté, que ce soit pour le séquençage ou pour l'automatisation des processus de préparation. De la réception des ADN, à la validation des données générées par le séquençage de nouvelle génération, l'équipe conduit l'ensemble des étapes en suivant des protocoles et des contrôles qualité éprouvés pour 

 

caractériser la qualité et la quantité d'ADN reçu afin de déterminer si les échantillons sont de qualité compatible avec les approches qui seront déployées pour le projet dans lequel ils s'inscrivent

 

optimiser la préparation des librairies pour obtenir une représentation la plus complète de la variété et des abondances des gènes et espèces présents dans les échantillons; ceci constitue une étape déterminante, en particulier pour les espèces et les gènes les moins abondants, pour des cohortes de toutes tailles. L'étape de préparation des librairies impacte également la qualité des séquences produites et l'identification ultérieure des gènes. 

 

Optimiser la longueur des séquences produites, en recherchant équilibre et performance entre production, délais et coûts de production

 

MetaQuant est actuellement en cours de préparation pour une certification ISO 9001. La capacité de la plateforme est en constante évolution, et notre capacité de production en augmentation avec pour but une capacité de 10000 échantillons par an d'ici 2017. Equipement : 4 séquenceurs 5500 Wildlife, 3 séquenceurs Ion Proton, un automate Biomek 3000, un automate FX3000.... 

L'équipe