Les antibiotiques perturbent le microbiote intestinal, mais qu’en est-il des phages – ces virus qui infectent les bactéries ?
Dans cette étude, 22 volontaires sains ont été suivis avant, pendant et jusqu’à 6 mois après une cure de 3 jours de céphalosporines de 3e génération.
Ce travail est le fruit d’une collaboration majeure entre les chercheurs de MetaGenoPolis (INRAE), de l’Institut Pasteur et de l’INSERM.
🔍 Résultats clés :
- Les phages intestinaux portent très rarement des gènes de résistance aux antibiotiques.
- Ils sont majoritairement tempérés, avec de nombreux phages-plasmides.
- Leur composition reste propre à chaque individu, même après traitement.
- Mais : un jour après les antibiotiques, la richesse et la diversité des phages chute de 20 % 📉, tandis que quelques phages virulents prolifèrent. Cette diversité a pu se rétablir par la suite.
- Certains phages semblent aider à restaurer la diversité bactérienne grâce à une dynamique “kill-the-winner”. Ils s’attaquent aux bactéries devenues dominantes à la suite du traitement antibiotique.
💡 Conclusion : les phages jouent un rôle clé dans la résilience du microbiote après antibiotiques – ils contribuent au retour de l’équilibre et de la diversité microbienne.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40694475/