MGP SOP 002 V1

PROTOCOLE D'OPÉRATION STANDARD POUR L'EXTRACTION ADN DES ÉCHANTILLONS FECAUX - Protocol H

Cette série de SOPs de MGP est la continuation des développements de standards effectués dans le cadre du projet original des Standards Internationaux du Microbiome Humain (IHMS). Ce SOP est une mise à jour de la version IHMS_SOP 006. Si vous souhaitez consulter les SOPs originaux de l’IHMS, veuillez consulter le site http://www.microbiome-standards.org/.

Ce SOP est recommandé en remplacement de la IHMS_SOP 007 V2 permettant au laboratoire d’optimiser la quantité d’ADN récupérée même en travaillant sur des échantillons à faible teneur en biomasse. Ce SOP est de premier intérêt pour une extraction fiable de l’ADN des échantillons fécaux, qu’ils contiennent une biomasse élevée ou faible, afin de caractériser le microbiote fécal par profilage métagénomique. Cependant, une version automatisée de cette procédure existe, permettant une extraction rapide et fiable de l’ADN d’échantillons à forte teneur en biomasse : voir MGP_SOP 001 V1.

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