A MetaGenoPolis, nous avons choisi la métagénomique shotgun pour étudier l’ensemble du matériel génétique des micro-organismes présents dans un échantillon de selles sans a priori. Cette technique de séquençage fournit une image plus précise du microbiote intestinal, à des rangs taxonomiques au niveau de l’espèce et souche. Elle permet également d’obtenir la fonctionnalité du contenu des gènes séquencés afin de formuler des hypothèses sur les potentiels fonctionnels du microbiote. Dans nos projets de recherche, nous cartographions le microbiote intestinal pour identifier quelles bactéries sont présentes et déterminer leur rôle.
Pour en savoir plus : texte_webinar_metagénomique_shotgun_MGP